El Club Fútbol Sala Fuentepelayo regresó en el año 2006 tras un breve paréntesis de cuatro años. Este nuevo equipo compite en la 2ª División Provincial de Fútbol Sala. Juan Pablo Zamora como presidente y Rebeca Aguilar como entrenadora llevan las riendas de este conjunto formado por 15 jóvenes, todos ellos de la localidad.
El equipo tiene una mezcla de veteranía y juventud, con una media de 25 años, y una enorme ilusión por llevar el nombre del municipio por toda la provincia.
Además, el C.F.S. Fuentepelayo cuenta con un equipo filial, que participa en la Liga Local del Taller Cultural, y con una escuela de Fútbol Sala para los más pequeños.
