Fuentepelayo cuenta con tres humedales: la Llosa, la Calzada y la Fuente de Paco García. Zonas de vital importancia para la conservación de la naturaleza y que no en pocos casos están siendo puestas en peligro por su fragilidad. Estos lugares nos asombran por su belleza y por la riqueza de su flora y su fauna.
El más importante de estos humedales es La Llosa. En esta zona podemos encontrar fresnos, sauces, chopos, castaños, abetos, saucos y pinos. En lo que se refiere a fauna, hay que destacar la garza común, la focha común y la gallina o polla de agua, carboneros, carpas, tencas, ranas, culebras, mirlos…